奶牛个体粪便排泄量在家畜中是最多的，是农业面源污染的主要因素之一。在当前大力建设社会主义新农村之际，加强奶牛养殖业环境保护关系改善农村卫生环境面貌和农村小康建设，关系发展循环经济和建设节约型社会，关系奶牛场的生存和奶业的可持续发展。这就要求在奶牛养殖业的发展过程中，要遵循以下几个原则。
　　 一、在建设和管理奶牛养殖小区和奶牛场时，业主要自觉遵守《环境保护法》、《水污染防治法》、《大气污染防治法》、《畜禽养殖污染防治管理办法》和《ISO1400系列环境管理标准》、《畜禽养殖业污染物排放标准》等法规和标准，严格控制环境污染。
　　 二、发展奶牛养殖业，切忌盲目扩张。根据当地土壤、气候、农作物种植和环境情况，对奶牛养殖小区和规模奶牛场进行合理选址和设计。特别是要考虑是否有足够的农田消纳奶牛粪污和提供优质饲料，走农牧结合的道路，建立“土地——种植业——奶牛养殖业”三位一体的农业生态系统，发展循环经济，形成“粮食多——饲料多——奶牛多——肥料多——粮食多”的良性循环，要转变奶牛生产方式，推行规范化和标准化管理，为奶牛饲养创造适宜环境，提高奶牛的生产性能和牛奶的质量，保证经济、环境和社会效益相统一。
　　 三、积极推广奶牛粪便处理和资源化利用技术。奶牛养殖小区和奶牛场要根据自身的实际情况积极推广高温堆肥还田、粪便固液分离和利用厌氧发酵生产沼气等先进实用技术，提高科学处理和利用奶牛粪便的水平。
　 四、相关政府职能部门加强对奶牛养殖业环境保护的宏观管理和政策扶持，提高奶牛养殖业的环境保护水平。